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最后更新：2014-03-04
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生產企業(yè)：創(chuàng)騰科技有限公司
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產品詳細介紹(Traditional Chinese Medicine Database, NeoSuite)
中藥新產品開發(fā)和現代化研究的綜合信息源，采用國際規(guī)范的信息表達體系全面定義了中英名稱，化學結構，各類數值，生物活性等數據。目前該庫收集化合物23,033種（截至2009年），其中8000種成分有藥理數據。涉及中藥藥用植物6735種，參考文獻5507篇（截至2005年），200種細胞水平抗癌模型，包括細胞因子網絡調節(jié)機制抗炎模型，各種抗氧化模型，酶抑制劑模型，NO抑制劑模型等。
產品介紹
中藥化學數據庫(Traditional Chinese Medicines Database，TCMdb2009中文版)是中科院過程工程研究所分子設計課題組在長期從事藥物設計方法研究的背景下，對數據庫工具的國內外需求進行分析，經多年努力研制成功的科學數據庫產品，是一個支持新藥研發(fā)和中藥現代化研究的新型工具。
TCMdb2009中文版是一個多學科交叉的科學數據庫，涉及中藥現代化研究、中藥化學、藥物化學、植物化學、化學信息學、中藥藥理學、分子藥理學、藥物設計學、天然產物研究與開發(fā)、新藥創(chuàng)制、新劑型中藥研發(fā)、新農藥及其它農用化學品的研發(fā)等諸多研究及開發(fā)領域。
TCMdb2009中文版中包含了23033種化合物，涉及中藥藥用植物6735種，使用參考文獻5507篇。每種化合物下列12項數據：唯一代碼、CAS登錄號、中文名稱、英文名稱、別名、分子式、分子量、二維結構式、植物來源、藥理活性（即藥理模型實驗結果，近8000多種化合物有此數據）、物理化學性質（晶體形態(tài)、熔點、沸點、旋光度等，14000多種化合物有此數據）和參考文獻。
產品特點：
• 8000種成分有藥理數據：200種細胞水平抗癌模型；細胞因子網絡調節(jié)機制抗炎模型；各種抗氧化模型；各種酶抑制劑模型；NO抑制劑模型等等。
• 信息表達體系完整嚴格：按國際規(guī)范全面定義了中英名稱、化學結構、各類數值、生物活性等數據結構、層次及格式，使相關學科信息表達和國際接軌。
• 保證數據一致性可靠性：采用多種交叉驗證方法保證信息準確可靠�；衔锪Ⅲw化學表達完整，并首次實現了藥理數據多層次結構規(guī)范化。
無論您是從中藥設計新西藥，還是研發(fā)新劑型新中藥，都可以把TCMdb中藥數據庫作為一種得力的工具，幫助您以最快速度分析并做出決策，解答任何與中藥有關的問題：
• 有多少化學成分做過抗癌實驗，哪些有活性？哪些沒有？IC50值多少？
• 以心血管藥物為研發(fā)目標的公司應該關注哪些中藥的研發(fā)動態(tài)？
• 從中藥出發(fā)創(chuàng)制抗高血壓新藥，哪些資源成功希望最大？
• 黃酮類化合物有多少種藥理活性？哪些活性最強？哪些活性譜最廣？
• 中藥傳統(tǒng)藥效有清熱、安神、解表、活血等，對應的藥理學概念是什么？
應用實例
從植物檢索化合物
給定一種中藥藥用植物，問該種植物都含有哪些化合物？ 嚴格的說法是：都有哪些化合物被從該種植物中分離并進行了結構確定？，TCMdb2009中文版數據庫能方便地完成這個任務。以三七為例，單擊菜單欄下方的“Query”按鈕，在query模式下激活“植物來源”域，鍵入“Like “%三七%””時，單擊菜單欄“Search”按鈕，單擊下拉菜單中的“By Form”，系統(tǒng)將擴展地檢出各種三七中含有的全部化合物，包括竹節(jié)三七等。
類別
方式
檢索域
鍵入
命中數
注解及說明
單項
SBF
植物來源
Like “%人參%”
180
檢出各種人參中含有的全部化合物
單項
SBF
植物來源
Like “%三七%”
156
檢出各種三七中含有的全部化合物，注意包括竹節(jié)三七等
化合物藥理活性數據檢索
在全庫的23033種化合物中，7000種化合物有藥理活性數據。這是研究QSAR/SAR關系的珍貴信息。用SBF方式，激活“藥理活性”域后，鍵入“Like “%藥理關鍵字%””，之后單擊菜單欄“Search”按鈕，單擊下拉菜單中的“By Form”，就得到下表中的結果。亦可采用QB方式，見下表中中間的三個例子：
類別
方式
檢索域
鍵入
命中數
注解及說明
單項
SBF
藥理活性
Like "%金黃色葡萄球菌%"
428
428個化合物有抗金黃色葡萄球菌數據
單項
SBF
藥理活性
Like "%細胞毒%"
2519
2519個化合物有體外抗腫瘤數據
單項
QB
藥理活性
property12 like "%抗腫瘤%"
638
638個化合物有體內抗腫瘤數據
單項
QB
藥理活性
property12 like "%抗高血壓%"
219
219個化合物有抗高血壓數據
單項
QB
藥理活性
property12 like "%抗腫瘤%" or property12 like "%細胞毒%"
2916
2916個化合物有體外或體內抗癌數據
單項
SBF
藥理活性
Like “%抗瘧%”
250, , ,
250個化合物有抗瘧數據
注意: 體外抗癌活性在庫中的規(guī)范表達方式是“細胞毒”，體內抗癌活性在庫中的規(guī)范表達方式是“抗腫瘤”。觀察化合物生物活性索引中的生物活性規(guī)范表達方式對于熟練使用數據庫是有好處的。
結構檢索
結構及子結構檢索是TCMdb2009中文版特有的功能。這一功能的實現對進行QSAR研究，進而研發(fā)新藥提供了巨大的幫助。這里只舉出最簡單的例子：將黃酮類化合物的特征分子骨架放入SBF方式下的structure檢索域，從庫中檢出包含黃酮骨架的化合物511個。具體命令見2.2節(jié)。用β-D-葡萄糖的分子骨架(含確切的立體化學信息)提問，得到1455個命中化合物。其它例子見下表：
類別
方式
檢索域
鍵入
命中數
注解及說明
單項
SBF
二維結構
1099
黃酮類化合物552個
單項
SBF
二維結構
427
二氫黃酮類化合物163個
單項
SBF
二維結構
566
香豆素類化合物295個
單項
SBF
二維結構
79
洋地黃毒強心甙59個
單項
SBF
二維結構
3715
含β-D-葡萄糖化合物1746個
用戶評價
TCMdb中藥數據庫2009年新版和科學出版社近日發(fā)行新書《中藥原植物化學成分集》基本相同，但文字/數值/結構復合型數據庫具有任何紙質書本不可能具有的強大檢索功能，和《中藥原植物化學成分集》配合使用，相得益彰，是完美的結合。國內專家對《中藥原植物化學成分集》一書的評論摘要如下：
“該書為中藥的現代化研究搭建了一個很好的信息平臺，達到了國際上同類工作的先進水平”（醫(yī)科院藥用植物所肖培根院士）
“該書內容豐富，資料完整，反映了國內外最新研究成果，對于充分利用我國中藥資源，促進中藥現代化研究，提升我國創(chuàng)新藥物研究水平，具有重要的科學價值“（中國藥理學會杜冠華理事長）
“該書為用綜合方法系統(tǒng)研究中藥首次提供了一套兩萬種以上中藥化學成分的數據集合……在理論層面上對臨床實踐有重要參考價值”（中醫(yī)科學院翁維良首席研究員）
除了該數據庫，直接用于受體對接、創(chuàng)建3D藥效團的TCMdb-2009-SCB/MCB單/多構象庫也同步發(fā)行。
數據收集評價和庫研制：NiceData北京翔實達特軟件研究開發(fā)中心
軟件開發(fā)及數據庫發(fā)行：NeoTrident創(chuàng)騰科技有限公司 |
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